Осторожно, возможен спойлер:
Посередине киносюжета кинофильма «Люди в черном» располагается представитель K (Томми Ли Джонс), многоопытный помощник негласной организации, занимающейся контролем и наблюдением за внеземными созданиями на Земле. Он работает совместно с новоиспеченным представителем J (Уилл Смит), который становится его напарником. Действие происходит в современных мегаполисах США, начиная с Нью-Йорка, где начинается их приключение.
Сюжет разворачивается, когда J получает поручение от организации «Люди в черном» - обнаружить и остановить внеземного преступника, который угрожает планете. Предварительно J не имеет опыта в подобных делах, но быстро обучается под руководством K. Вместе они исследуют различные локации, встречаются с необычными созданиями и раскрывают заговор, который может повлиять на всю Землю. В ходе своих приключений они сталкиваются с множеством препятствий, включая агрессивных пришельцев и предательство внутри своей организации.
По мере развития событий J и K открывают тайны, которые представляют опасность не только для их жизни, но и для безопасности всего человечества. Им предстоит разобраться в сложных взаимоотношениях между разнообразными внеземными расами и выяснить, кто на самом деле является врагом. Однако, несмотря на все трудности, между представителями вырабатываются дружеские отношения, что помогает им в их борьбе. Но что ждет их впереди, когда скрытые силы начинают раскрываться?